经过升级的新版软件ECR50与专为DNBSEQ-T7设计的甲基化高通量测序试剂套装(T7MethylationFCLPE150)现已同步上线。即日起,用户可享受软件升级服务及甲基化测序试剂套装的采购,详细的订购指南见文末。
DNBSEQ-T7甲基化高通量测序进展
与此同时,最新一代建库产品MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(以下简称“WGMSV30”)已成功与DNBSEQ-T7平台适配。结合优化后的升级算法,搭配DNBSEQ-T7RS甲基化高通量测序试剂套装,实现了在测序时大幅降低平衡文库的混合比例,甚至无需添加平衡文库,达到“100%纯甲基化文库”的高质量测序。
用户例证
在用户案例方面:
- 用户坐标:天津
样本类型:人、猪、植物
建库试剂:第三方
测序方案:100%甲基化文库 - 用户坐标:武汉
样本类型:多样本混测(人、昆虫、水果、植物、鱼类等)
建库试剂:第三方 - 用户坐标:上海
样本类型:人肿瘤样本
建库试剂:第三方 - 用户坐标:哈尔滨
样本类型:人标准品
建库试剂:MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30
高质量测序的实现
通过MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库,12个甲基化文库通过DNB等量pooling,不添加平衡文库,便可在DNBSEQ-T7平台进行测序。每张芯片均能获得高reads产出,确保测序质量良好,且对每张芯片上12个样本进行数据拆分后,每个样本的raw base≥100Gb,Q30%均在92%以上。
数据利用率与一致性的提高
在数据有效性方面,选取不同批次样本、不同建库试剂批次、不同建库起始量下的9个样本文库进行分析,每个样本截取100Gb raw data,采用MGI的全基因组甲基化软件进行生信分析,结果显示,不同建库起始量的文库在DNBSEQ-T7的测序数据clean rate≥99%,Uniquely Mapped Rate(%)≥90%,Duplication Rate(%)≤5%,平均测序深度一律≥30x,全基因组10×coverage可达≥96%,充分展现出数据的高利用率。
甲基化检测一致性及性能
分析随机挑选的3个NA12878甲基化文库,在4×测序深度下检测到的独有和共享CpG位点显示,3个文库的甲基化文库的CpG位点覆盖一致性达94%。相较于935K芯片,MGI WGMSV30搭配DNBSEQ-T7的测序方法在甲基化检测一致性上表现更为突出,检测到的位点占比也更高。
未来展望与合作
在2024年,华大智造的高通量旗舰机DNBSEQ-T7相继被凌恩生物、欧易生物等生态伙伴引入,展现了其在市场上的强大产品力。这一成果不仅体现了DNBSEQ-T7平台的高效、高质,同时也彰显了市场对于华大智造技术与产品的认可与信赖。作为生命科技核心工具的提供者,华大智造将继续与全球生态伙伴携手,推进高通量测序技术在科研和临床实践中的应用。
强大的品牌愿景是,围绕生命的“读、写、存”,以“SEQALL”(全读长)为目标,华大智造将持续推出更灵活、更多元的生命解码工具,助力生命科技真正走入千家万户。未来,尊龙凯时将不断优化提升甲基化测序领域的技术实力,为生命科学的创新与发展贡献力量。